Na styku dwóch różnych ekosystemów wykształca się strefa przejściowa między oboma ekosystemami. Taką strefę przejściową nazywamy ekotonem. Występują tu gatunki z obu ekosystemów oraz gatunki specyficzne tylko dla strefy przejściowej. Ekotony, ze względu na dużą ilość różnorodnych nisz ekologicznych, są zwykle terenami o dużej różnorodności biologicznej. Przykładami ekotonów jest na przykład brzeg jeziora (styk wody i lądu) na którym występuje specyficzna roślinność strefowa czy styk lasu z terenem otwartym. Strefę przejściową między lasem i terenem otwartym nazywamy okrajkiem. W dobrze wykształconym okraju obecne są warstwy roślinności: krzewy (często dziki bez), pnącza (np. chmiel) i rośliny zielne (jak np. pokrzywa). Okrajek chroni las przed wiatrami czy mrozami, ale stanowi też siedlisko życia wielu gatunków zwierząt, na przykład ptaków regulujących liczebność owadów żerujących na uprawach.